Kuidas teadlased mikrokiibi analüüsi kasutavad?

Mikrokiibi analüüs hõlmab raku avamist, selle geneetilise sisu eraldamist, kõigi selles konkreetses rakus sisse lülitatud geenide tuvastamist ja nende geenide loendi koostamist. DNA mikrokiibi analüüs on tehnika, mida teadlased kasutavad, et teha kindlaks, kas geenid on sisse või välja lülitatud.

1. Milleks kasutatakse mikrokiibi analüüsi?
2. Miks teadlased kasutavad mikrokiibi?
3. Kuidas tänapäeval kasutatakse mikrokiibi analüüsi?
4. Mida suudab mikrokiibi analüüs tuvastada?
5. Mis on mikrokiip bioinformaatikas?
6. Mis on eksonite püüdmise eesmärk?
7. Millised on mikrokiibi rakendused?
8. Mis on DNA mikrokiipide tähtsus?
9. Kuidas teadlased määravad kindlaks organismi geneetilise järjestuse?
10. Kuidas mikrokiip töötab ja kuidas seda kasutatakse?
11. Millist järgmistest tehnoloogiatest kasutatakse mikrokiibi valmistamisel?
12. Milliseid tööriistu kasutatakse mikrokiibi analüüsiks?
13. Mis on mikrokiibi tehnika?
14. Kui täpne on mikrokiibi testimine?
15. Mida saab CMA tuvastada?

Milleks kasutatakse mikrokiibi analüüsi?

Mikrokiip on laboritööriist, mida kasutatakse tuhandete geenide ekspressiooni samaaegseks tuvastamiseks. DNA mikrokiibid on mikroskoobi slaidid, millele trükitakse kindlaksmääratud positsioonides tuhanded pisikesed täpid, kusjuures iga täpp sisaldab teadaolevat DNA järjestust või geeni.

Miks teadlased kasutavad mikrokiibi?

Tegelikult võimaldab mikrokiibi analüüs teadlastel vaadata ekspressioonimustreid kogu genoomi kõigis geenides – ja teha seda ühe protseduuriga. Tänu sellele on nüüd võimalik samaaegselt jälgida kümnete tuhandete geenide tegevust.

Kuidas tänapäeval kasutatakse mikrokiibi analüüsi?

Tänapäeval kasutatakse DNA mikrokiipe mõnede haiguste kliinilistes diagnostilistes testides. ... Mikrokiipide abil saab uurida ka seda, mil määral on teatud geenid rakkudes ja kudedes sisse või välja lülitatud. Sel juhul eraldatakse ja mõõdetakse DNA proovidest eraldamise asemel RNA (mis on DNA transkriptsioon).

Mida suudab mikrokiibi analüüs tuvastada?

Mida tuvastab kromosomaalne mikrokiibi? Kromosomaalse mikrokiibi (CMA) testimine otsib täiendavaid (dubleeritud) või puuduvaid (kustutatud) kromosomaalseid segmente, mida mõnikord nimetatakse koopiaarvu variantideks (CNV).

Mis on mikrokiip bioinformaatikas?

"Mikrokiibi" on klaasist valmistatud laboriklaas, mille pinnal on määratletud kohtades tuhanded väikesed poorid. See töötab DNA komplementaarsete ahelate hübridisatsiooni põhimõttel ja võimaldab meil tõhusalt analüüsida mitme geeni ekspressioone ühes reaktsioonis.

Mis on eksonite püüdmise eesmärk?

Eksonite püüdmine on molekulaarbioloogia meetod potentsiaalsete eksonite tuvastamiseks tundmatu intron-eksoni struktuuriga eukarüoot-DNA fragmendis. Seda tehakse selleks, et teha kindlaks, kas fragment on ekspresseeritud geeni osa.

Millised on mikrokiibi rakendused?

Praegune mikrokiibi rakenduste ulatus hõlmab sekveneerimist hübridisatsiooni teel, uuesti sekveneerimist, mutatsioonide tuvastamist, geenikoopiate arvu hindamist, võrdlevat genoomi hübridisatsiooni, ravimite avastamist, ekspressioonianalüüsi ja immuunanalüüsi (valgu mikrokiibid).

Mis on DNA mikrokiipide tähtsus?

DNA mikrokiip on tõhus vahend transkriptoomikas, mis aitab meil uurida ja analüüsida peaaegu iga organismis esineva geeni mRNA ekspressiooni. Mikroorganismide kogu genoomi järjestuse olemasolu tõttu on nüüdseks saanud võimalikuks identifitseerida geenid, millel on potentsiaali bioremediatsiooniks.

Kuidas teadlased määravad kindlaks organismi geneetilise järjestuse?

Need tähed ja värvid esindavad DNA-koodi – kemikaale, mis moodustavad osa meie geneetilisest plaanist. Teadlased saavad võtta organismidelt tampooni abil proove ja "lugeda" nende DNA-d läbi protsessi, mida nimetatakse DNA sekveneerimiseks.

Kuidas mikrokiip töötab ja kuidas seda kasutatakse?

Mikrokiipide põhimõte seisneb selles, et komplementaarsed järjestused seostuvad üksteisega. Tundmatud DNA molekulid lõigatakse restriktsiooniendonukleaaside abil fragmentideks; fluorestseeruvad markerid on kinnitatud nende DNA fragmentide külge. Seejärel lastakse neil reageerida DNA kiibi sondidega.

Millist järgmistest tehnoloogiatest kasutatakse mikrokiibi valmistamisel?

Mikrokiipe saab valmistada mitmesuguste tehnoloogiate abil, sealhulgas trükkimine peeneteraliste tihvtidega slaididele, fotolitograafia, kasutades eelnevalt valmistatud maske, fotolitograafia dünaamiliste mikropeegelseadmete abil, tindipritsiga printimine või elektrokeemia mikroelektroodide massiividel.

Milliseid tööriistu kasutatakse mikrokiibi analüüsiks?

Ainult kolm tööriista saavad hakkama igat tüüpi klassikaliste mikrokiipidega, nimelt ArrayExpress ja NCBI GEO salvestamiseks ning Bioconductor analüüsiks.

Mis on mikrokiibi tehnika?

Microarray tehnoloogia on arenev tehnoloogia, mida kasutatakse paljude geenide ekspressiooni korraga uurimiseks. See hõlmab tuhandete geenijärjestuste paigutamist teadaolevatesse kohtadesse klaasslaidile, mida nimetatakse geenikiibiks. DNA-d või RNA-d sisaldav proov asetatakse kontakti geenikiibiga.

Kui täpne on mikrokiibi testimine?

CMA on 100% täpne sünnieelsete proovide tavaliste aneuploidide tuvastamisel võrreldes karüotüübiga (2, 16, 17) ja NICHD uuringus näitas see suuremat diagnostilist saagikust võrreldes standardse karüotüübi määramisega 1.7% patsientidest, kes on suunatud kaugelearenenud emade, vanemate ärevuse ja positiivse seerumi sõeluuringule (2).

Mida saab CMA tuvastada?

Sünnieelne CMA võrdleb sündimata lapse DNA spetsiifilisi piirkondi normaalse genoomi omadega. CMA suudab tuvastada kromosomaalseid dubleerimisi või deletsioone – kohti, kus on täiendavaid või puuduvaid DNA tükke –, mida standardse karüotüübi testimisega ei tuvastata.